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clustalo安装
阅读量:6827 次
发布时间:2019-06-26

本文共 1812 字,大约阅读时间需要 6 分钟。

需要准备下载压缩包:

 argtable2_12.orig.tar   (https://launchpad.net/ubuntu/+source/argtable2/13-1) 

 clustalo_1.2.4.orig.tar   (https://launchpad.net/ubuntu/+source/clustalo/1.2.4-2或者http://www.clustal.org/omega/下载)

安装clustalo之前,先安装argtable2-12,否则在安装clustalo(./configure)时会报下面的错误:

configure: error: Could not find argtable2.h. Try $ ./configure CFLAGS='-Iyour-argtable2-include-path 安装argtable2: tar -zxvf argtable2_12.orig.tar  # 解压 cd argtable2-12/  ./configure --prefix=/user/path/   # 配置  make check          # 检测  make && make install   # 编译安装 环境变量设置: vim ~/.bashrc  #进入启动配置文件                export PATH=/public/home/wangh/Programs/argtable2-12:$PATH                export PATH=/public/home/wangh/Programs/argtable2-12/bin:$PATH                export PATH=/public/home/wangh/Programs/argtable2-12/include:$PATH                export LD_LIBRARY_PATH=/public/home/wangh/Programs/argtable2-12/bin:$LD_LIBRARY_PATH               source ~/.bashrc # 更新启动配置文件 安装clustalo: tar -zxvf clustalo_1.2.4.orig.tar  # 解压 cd clustal-1.2.4 ./configure --prefix=/user/path/   # 配置  make check          # 检测  make && make install   # 编译安装 环境变量设置: vim ~/.bashrc  #进入启动配置文件                 export PATH=/public/home/wangh/Programs/clustal-1.2.4:$PATH                 export PATH=/public/home/wangh/Programs/clustal-1.2.4/bin:$PATH                 export PATH=/public/home/wangh/Programs/clustal-1.2.4/include:$PATH               source ~/.bashrc # 更新启动配置文件 可能还会在配置(./configure)出错:configure: error: Could not find argtable2.h. Try $ ./configure CFLAGS='-Iyour-argtable2-include-path 解决方法: ./configure CFLAGS='-I/public/home/wangh/Programs/argtable2-12/include' LDFLAGS='-L/public/home/wangh/Programs/argtable2-12/lib' --prefix=/public/home/wangh/Programs/clustal-omega-1.2.4 在进行编译安装 和环境变量的设置

转载于:https://www.cnblogs.com/wh-ff-ly520/p/10281711.html

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